準備注意事項protrap xg 設備經(jīng)過優(yōu)化,可處理 50 μg 蛋白質(zhì)。對于可重現(xiàn)和最大的蛋白質(zhì)沉淀,沉淀過程中樣品中的最大sds含量應為1%。如果您的提取或裂解緩沖液含有超過 1% sds,請使用最大離子強度為 300 mm 的緩沖液稀釋。離心速度基于帶 24 x 1.5/2.0 ml 轉(zhuǎn)子的標準臺式微量離心機。提供的時間僅供參考。如果過濾濾芯中殘留的液體超過幾微升,請將其返回到離心機并重復旋轉(zhuǎn),或考慮提高旋轉(zhuǎn)速度。建議在后續(xù)旋轉(zhuǎn)中使用 3000 ×g (6000 rpm),protrap xg 已經(jīng)過高達 9000 ×g (10,000 rpm) 的測試。
所需材料所有化學品和試劑應為acs級/hplc級或更高。丙酮5 m 氯化鈉水溶液80%甲酸水溶液(冷卻至–20°c)冷凍水
自上而下的樣品制備方案
對于可重現(xiàn)和最大的蛋白質(zhì)沉淀,沉淀過程中樣品中的最大sds含量應為1%。如果您的提取或裂解緩沖液含有超過 1% sds,請使用最大離子強度為 300 mm 的緩沖液稀釋。 為獲得最佳體驗,樣品應至少含有 50 mm nacl。 如果需要添加氯化鈉,請使用 5 m 氯化鈉溶液。
不要讓過濾濾芯中的膜在步驟之間變干。
將塞子擰到濾芯的底座上。
將 100 μl 稀釋的樣品蛋白轉(zhuǎn)移到堵塞的過濾柱中。
加入 400 μl 室溫丙酮。
蓋上過濾濾芯并輕輕搖晃,傾斜不超過 45°,以混合溶劑。
將過濾柱插入微量離心管中,等待 30 分鐘,使蛋白質(zhì)在室溫下聚集。
連接塞子后,以 2500 × g (5000 rpm) 離心×2 分鐘。
從微量離心管中取出過濾盒,倒置并擰下塞子。
將帶蓋的過濾柱放回微量離心管中,并以 500 × (2000 rpm) 離心×3 分鐘。 丟棄通過溶劑的流量。 如果過濾濾芯中殘留任何溶劑,請以 3000 ×g (6000 rpm) 的速度重新旋轉(zhuǎn)裝置 2-5 分鐘。
用 400 μl 丙酮清洗蛋白質(zhì)顆粒。立即以 500 × g (2000 rpm) × 2 分鐘離心。丟棄流過洗滌溶劑的流。
更換插頭。在 –20°c 下將過濾筒中的沉淀物冷卻 10 分鐘。
在水中加入 50 µl 冷 (-20°c) 80% 甲酸。蓋上濾芯,放入冰箱 10 分鐘,然后超聲處理 1 分鐘。
加入 450 µl 冷凍水;蓋并渦旋以混合溶劑。
完整的蛋白質(zhì)可以在干凈的微量離心管中直接回收,以 350 × g (2000 rpm) × 5 分鐘的速度離心。
如果需要進一步的蛋白質(zhì)凈化,再溶解的蛋白質(zhì)也可以使用提供的可選 spe 小柱和 spe蛋白質(zhì)/肽凈化方案進行 spe 。