有機(jī)肥發(fā)酵劑在堆肥過(guò)程中有機(jī)質(zhì)的轉(zhuǎn)化堆肥中的有機(jī)質(zhì)在微生物的作用下發(fā)生復(fù)雜的轉(zhuǎn)化，可概括為兩個(gè)過(guò)程：一是有機(jī)質(zhì)的礦化過(guò)程，即復(fù)雜有機(jī)質(zhì)分解為簡(jiǎn)單物質(zhì)，生成二氧化碳、水、礦質(zhì)養(yǎng)分等；另一個(gè)是有機(jī)質(zhì)的腐殖化過(guò)程，即有機(jī)質(zhì)經(jīng)過(guò)分解和合成，形成更為復(fù)雜的有機(jī)質(zhì)——腐殖質(zhì)。這兩個(gè)過(guò)程同時(shí)進(jìn)行，但方向相反。在不同的條件下，每個(gè)過(guò)程的強(qiáng)度明顯不同。
一、有機(jī)質(zhì)的礦化作用：1.無(wú)氮有機(jī)物分解的多糖類(lèi)化合物（淀粉、纖維素、半纖維素）首先被微生物分泌的水解酶水解成單糖。葡萄糖在通風(fēng)良好的條件下分解迅速，中間產(chǎn)物酒精、乙酸、草酸等不易積累，盡量形成co2和h2o，同時(shí)釋放出大量熱能。如果曝氣不良，在厭氧微生物的作用下，單糖分解較慢，產(chǎn)生的熱量較少，并積累一些中間產(chǎn)物——有機(jī)酸。在厭氧微生物條件下，還會(huì)產(chǎn)生ch4、h2等還原性物質(zhì)。
2.堆肥中的含氮有機(jī)物包括蛋白質(zhì)、氨基酸、生物堿、腐殖質(zhì)等。除腐殖質(zhì)外，大部分易分解。例如，在微生物分泌的蛋白酶作用下，蛋白質(zhì)逐步降解，產(chǎn)生各種氨基酸，再經(jīng)氨化和硝化，分別形成銨鹽和硝酸鹽，被植物吸收利用。
3.堆肥中的有機(jī)肥發(fā)酵劑在含磷有機(jī)化合物在各種腐生微生物的作用下形成磷酸，成為植物可以吸收利用的養(yǎng)分。
4.堆肥中含硫有機(jī)物的轉(zhuǎn)化，通過(guò)微生物的作用產(chǎn)生硫化氫。硫化氫在厭氧環(huán)境中容易積累，對(duì)植物和微生物有毒害作用。但在良好的曝氣條件下，硫化氫在硫細(xì)菌的作用下被氧化成硫酸，并與堆肥中的鹽基形成硫酸鹽。既消除了硫化氫的毒性，又成為植物可以吸收的硫素養(yǎng)分。在通風(fēng)不良的情況下，發(fā)生脫硫，將硫酸轉(zhuǎn)化為h2s并損失，使植物中毒。在堆肥發(fā)酵過(guò)程中，通過(guò)定期周轉(zhuǎn)等措施提高堆肥的通氣性，可以消除抗硫化效應(yīng)。
5.有機(jī)肥發(fā)酵劑在脂類(lèi)和芳香族有機(jī)化合物如單寧、樹(shù)脂等結(jié)構(gòu)復(fù)雜，分解緩慢，產(chǎn)物也是co2和水。木質(zhì)素在含有植物原料（如樹(shù)皮、鋸末等）的堆肥中是一種比較穩(wěn)定的有機(jī)化合物。它具有復(fù)雜的結(jié)構(gòu)，含有芳香核，以比較難分解的聚合物形式存在于植物組織中。在良好的通氣條件下，主要通過(guò)真菌和放線菌的作用緩慢分解，其芳香環(huán)可轉(zhuǎn)變?yōu)轷?lèi)化合物。是合成腐殖質(zhì)的原料之一。當(dāng)然，這些物質(zhì)在條件下還會(huì)繼續(xù)分解。