肽可以被定義為更大的功能蛋白質(zhì)的片段。它們通常被設(shè)計成模擬特定的生物學(xué)作用，例如與互補抗體的功能性結(jié)合位點反應(yīng)的能力。這種特性被稱為抗原性，產(chǎn)生的分子通常被稱為抗原性肽。這些怎么樣合成肽設(shè)計的？以及如何將它們用于產(chǎn)生新的抗體療法？產(chǎn)生免疫性的對抗抗原肽，有什么區(qū)別？抗原性是指抗原與抗體的功能結(jié)合位點相互作用的能力，也稱為副表位。免疫原性是指分子引發(fā)體液和/或細(xì)胞免疫反應(yīng)的能力?？乖瓫Q定簇(抗體)和抗原決定簇(抗原)之間的相互作用是免疫原性和抗原性的根本驅(qū)動力。然而，重要的是要注意，盡管所有的免疫原性肽都具有抗原性，但并非所有的抗原性肽都具有免疫原性。
抗原性肽往往比免疫原性肽短，保留了與抗原決定簇相互作用的能力，但不能引發(fā)免疫反應(yīng)。它們不能引發(fā)這種反應(yīng)是因為它們的結(jié)構(gòu)短且呈線性，有時是因為它們與宿主蛋白的序列相似。
盡管免疫原性和抗原性肽的大多數(shù)應(yīng)用重疊，但仍有一些區(qū)分的理由。例如，免疫原性肽本質(zhì)上更難設(shè)計和生產(chǎn)，因為它們不僅需要具有抗原性，還需要被施用它們的生物體識別為外來的。
使抗原性肽具有免疫原性可以通過以下方法實現(xiàn)與載體蛋白或病毒樣蛋白融合。這些策略已成功地應(yīng)用于生產(chǎn)肽疫苗或者抗體生成應(yīng)用(雜交瘤或多克隆抗體生產(chǎn)).
利用免疫原性肽產(chǎn)生的抗體通常被稱為抗肽抗體。它們可以與原始的完整蛋白質(zhì)發(fā)生交叉反應(yīng)，這使得它們對于分離、監(jiān)測和定位蛋白質(zhì)表達(dá)非常有價值。在基礎(chǔ)水平上，肽抗體也可用于表征蛋白質(zhì)天然構(gòu)象中的表位。
非免疫原性抗原肽，由于其易于生產(chǎn)，仍可用于其他應(yīng)用。例如，它們可以作為配體使用展示技術(shù)(例如噬菌體展示)篩選高度多樣化的抗體庫。此外，它們可以作為試劑或標(biāo)準(zhǔn)用于蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用研究或多重免疫測定。
肽的結(jié)構(gòu)與抗原性的關(guān)系就肽的抗原性而言，結(jié)構(gòu)是一個至關(guān)重要的特性。在不同的免疫測定中，相同的多肽序列可能導(dǎo)致不同的抗原反應(yīng)。這些巨大差異的原因源于肽本身的構(gòu)型。
例如，溶液中的游離肽通常是線性的并暴露，而吸附到樹脂或其他固體噬菌體上的肽僅部分暴露。后者有很大一部分表面不能結(jié)合，這限制了它們的抗原性。
相反，由于載體誘導(dǎo)的構(gòu)象變化，與載體結(jié)合的肽甚至可能比游離肽更具抗原性。這些肽通常呈現(xiàn)能被抗體更好識別的三維結(jié)構(gòu)。
用于成功增加抗原性的另一種策略是環(huán)化。許多專家認(rèn)為環(huán)肽是理想的治療藥物。環(huán)化可以增加肽的穩(wěn)定性，使其更能抵抗蛋白水解切割。此外，研究表明，它增加了膜的滲透性，使它們更好地瞄準(zhǔn)傳統(tǒng)上“不可拖動”的疾病標(biāo)記。
抗原肽和模擬表位抗原性肽或表位通常分為連續(xù)或不連續(xù)，這取決于參與與副表位相互作用的氨基酸殘基是否彼此相鄰。事實上，大多數(shù)天然表位是不連續(xù)的，由序列中不相鄰的殘基組成，但由于同源完整蛋白的構(gòu)象而變得鄰近。
然而，這種分類很少是直截了當(dāng)?shù)?。事實上，即使在連續(xù)區(qū)域內(nèi)，也不是每個殘基都與副表位接觸，這些不相互作用的殘基通?？梢员蝗魏纹渌被崛〈?，而不會損害肽的抗原性。此外，不連續(xù)肽由被非反應(yīng)性區(qū)域分隔的多個連續(xù)區(qū)域組成。沒有高質(zhì)量的晶體學(xué)數(shù)據(jù)，很難根據(jù)表位-表位相互作用對肽進(jìn)行分類。
抗體的多重特異性通常會產(chǎn)生另一種抗原肽——模擬表位。模擬表位在結(jié)構(gòu)上與表位相似，它們引發(fā)與表位相似的免疫反應(yīng)，但在序列上有顯著差異。
這些肽通常通過篩選組合肽庫或通過噬菌體展示進(jìn)行生物淘選來鑒定。連續(xù)表位和不連續(xù)表位都可以具有與原始蛋白質(zhì)幾乎沒有相似性的模擬表位。這種現(xiàn)象可以用模擬表位關(guān)鍵區(qū)域存在相似的原子團(tuán)來解釋。此外，單個抗體包含許多不重疊或僅部分重疊的表位，每個表位能夠結(jié)合相似或不同的表位。
模擬表位具有多種應(yīng)用，包括功能和結(jié)構(gòu)研究、過敏原特異性免疫療法(其中有害的表位被結(jié)構(gòu)相似的模擬表位取代)、疫苗和診斷學(xué)等。