醫(yī)用污水處理設(shè)備的運用原理就是采用各種技術(shù)和手段，將污水中所含的污染物質(zhì)分離去除、回收利用或?qū)⑵滢D(zhuǎn)化為無害物質(zhì)，使水得到凈化?，F(xiàn)代污水處理技術(shù)按原理可分為物理處理法化學(xué)處理法、生物處理法三類；按處理程度劃分，可分為一級處理、二級處理和三級處理，三級處理又稱深度處理。
物理處理法是利用物理作用分離污水中呈懸浮國體狀態(tài)污染物質(zhì)的方法。主要方法有：格柵截留法、沉淀法、氣浮法和過濾法等。
化學(xué)處理法是利用化學(xué)反應(yīng)的作用分離回收污水中各種污染物質(zhì)的方法，醫(yī)用污水處理設(shè)備只要用于處理工業(yè)廢水。主要方法有：中和、混凝、電解、氧化還原、汽提、萃取、吸附和離子交換等
生物處理法是利用醫(yī)用污水處理設(shè)備中的微生物的代謝作用使污水中呈溶解、膠體狀態(tài)的有機污染物轉(zhuǎn)化為穩(wěn)定的無害物質(zhì)的方法。主要方法有好氧法和厭氧法兩大類，好氧法廣泛應(yīng)用于處理城市污水及有機性工業(yè)廢水，厭氧法則多用于處理高濃度有機廢水與污水處理過程中產(chǎn)生的污泥。