crispr是一種常用的基因編輯技術(shù)，crispr/cas 系統(tǒng)被開發(fā)成一種高效的基因編輯工具。在自然界中，crispr/cas系統(tǒng)擁有多種類別，其中 crispr/cas9 系統(tǒng)是研究最深入，應(yīng)用相對成熟的一種類別。crispr系統(tǒng)在實驗過程中，需要對實驗環(huán)境進行核酸污染控制。德國mb公司生產(chǎn)的pcr-clean，高效清除實驗環(huán)境或?qū)嶒瀮x器上的dna、rna，和各種核酸酶污染，高效清除核酸相關(guān)污染，為分子實驗保駕護航。
轉(zhuǎn)錄終止子，是決定信號rna聚合酶（rnaps）在何處停止，并與dna解離關(guān)鍵點。然而，由于終止是隨機的，可能會產(chǎn)生兩種不同形式的轉(zhuǎn)錄本：一種在終止子處終止，另一種繼續(xù)讀取。能夠控制這些轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體的豐度將為生物工程師提供在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控多基因構(gòu)建的機制。
近日，科研人員通過重新利用終止子作為“轉(zhuǎn)錄閥”，調(diào)節(jié)rnap讀取的比例，探索了這一可能性。
相關(guān)研究發(fā)表在《nature communications》上，文章標題為：“massively parallel characterization of engineered transcript isoforms using direct rna sequencing”
通過使用混合dna組裝，科研人員迭代構(gòu)建了1780個t7 rnap的轉(zhuǎn)錄閥，并展示了如何使用基于納米孔的直接rna測序（drna-seq）來在體外同時以核苷酸分辨率表征整個閥門庫，并揭示調(diào)控和隔離終止的遺傳設(shè)計原則。
最后，科研人員為crispr引導(dǎo)rna的多路調(diào)控工程設(shè)計了閥門。這項工作為控制轉(zhuǎn)錄提供了新的途徑，展示了長讀取測序在探索復(fù)雜的序列-功能景觀方面的好處。