次氯酸鈉發(fā)生器設備和二氧化氯發(fā)生器的工作原理不同，次氯酸鈉發(fā)生器是電解鹽的一種物理化學反應(理化反應)，電解電極陽極采用銥釕涂層的鈦合金材料，陰極采用鈦合金，通過高頻直流電源電解，在陽極生成氫氧化鈉和氯器，氫氣化鈉和氯器+水二次反應生成次氯酸鈉，氫氣排出，次氯酸鈉溶液流到儲藥箱，這一過程不單單是電解過程，還融合了化學的反應。二氧化氯是鹽酸和氯酸鈉在一定溫度下反應生成的二氧化氯，是一種化學反應。簡單來說原材料不同，次氯酸鈉發(fā)器只需要鹽，而二氧化氯發(fā)生器是要采用鹽酸和氯酸鈉(都是危險品，不易管理)。
次氯酸鈉發(fā)生器設備和二氧化氯發(fā)生器同等殺菌效果的設備，次氯酸鈉的制造成本遠遠高于二氧化氯發(fā)生器。次氯酸鈉發(fā)生器對電解電源、電極組有很高的要求。采用劣質的不銹鋼電極和純鈦電極，使用壽命短、且效率低，既費電又浪費鹽。二氧化氯的組成和要求相比簡單。主要是由計量泵、反應槽、加熱系統(tǒng)完成，且對反應槽要求也不是特別高。
二氧化氯發(fā)生器它的投藥方式也十分的方便，可以直觀顯示并方便調(diào)節(jié)各點加藥量，一臺發(fā)生器也可以向多個投藥點同時定量加藥，對于需要同時進行源水予氧化和濾后消毒及出廠水補氯的水廠，這種配置的適用性是很強的。二氧化氯發(fā)生器的進水管路可用鐵管或塑料管，出藥管路須用聚氯乙烯或abs塑料管，以免藥物對金屬管道的腐蝕造成設備損失。