先將塑料筒的一頭扎起來，扎口方法有兩種：
1.將采用側(cè)面打穴接種的塑料筒，先用尼龍繩把塑料筒的一端扎兩圈，然后將筒口折過來扎緊，這樣可防止筒口漏氣。
2.有的生產(chǎn)者采用17×35㎝短塑料筒裝料，兩頭開口接種，也要把塑料筒的一端用力扎起來，但不必折過來再扎了。扎起一頭的塑料筒稱為塑料袋，裝袋前要檢查是否漏氣。檢查方法是將塑料袋吹滿氣，放在水里，看有沒有氣泡冒出。漏氣的塑料袋不能用。用裝袋機(jī)裝袋5人一組，1個(gè)人往料斗里加料；2個(gè)人輪流將塑料袋套在出料筒上，一手輕輕握住袋口，一手用力頂住袋底部，盡量把袋裝緊，越緊越好，另外2個(gè)人整理料袋扎口，一定要把袋口扎緊扎嚴(yán)，扎的方法同袋的另一端。手工裝袋，要邊裝料，邊抖動(dòng)塑料袋，并用粗木棒把料壓緊壓實(shí)，裝好后把袋口扎嚴(yán)扎緊。裝好料的袋稱為料袋。在高溫季節(jié)裝袋，要集中人力快裝，一般要求從開始裝袋到裝鍋滅菌的時(shí)間不能超過6小時(shí)，否則料會(huì)變酸變臭。料袋裝鍋時(shí)要有一定的空隙或者“#”字型排壘在滅菌鍋里，這樣便于空氣流通，滅菌時(shí)不易出現(xiàn)死角。采用高壓蒸汽滅菌時(shí)，料袋必須是聚丙烯塑料袋，加熱滅菌隨著溫度的升高，鍋內(nèi)的冷空氣要放凈，當(dāng)壓力表指向1.5公斤/平方厘米時(shí)，維持壓力2小時(shí)不變，停止加熱自然降溫，讓壓力表指針慢慢回落到0位時(shí)，先打開放氣閥，再開鍋出鍋。采用常壓蒸汽滅菌鍋，開始加熱升溫時(shí)，火要旺要猛，從生火到鍋內(nèi)溫度達(dá)到100℃的時(shí)間不超過4小時(shí)，否則會(huì)把料蒸酸蒸臭。當(dāng)溫度到100℃后，要用中火維持8～10小時(shí)，中間不能降溫，zui后用旺火猛攻一會(huì)兒，再?；馉F一夜后出鍋。出鍋前先把冷卻室或接種室進(jìn)行空間消毒。
出鍋用的塑料筐也要噴灑2%的來蘇水或75%的酒精消毒。把剛出鍋的熱料袋運(yùn)到消過毒的冷卻室里或接種室內(nèi)冷卻，待料袋溫度降到30℃以下時(shí)才能接種。
香菇料袋多采用側(cè)面打穴接種，要幾個(gè)人同時(shí)進(jìn)行，所以在接種室和塑料接種帳中操作比較方便。具體作法是先將接種室進(jìn)行空間消毒，然后把剛出鍋的料袋運(yùn)到接種室內(nèi)一行一行、一層一層地壘排起，每壘排一層料袋，就往料袋上用手持噴霧器噴灑一次0.2%多霉靈；全部料袋排好后，再把接種用的菌種、膠紙，打孔用的直徑1.5～2厘米的圓錐形木棒、75%的酒精棉球、棉紗、接種工具等準(zhǔn)備齊全。關(guān)好門窗，打開氧原子消毒器，消毒40分鐘；關(guān)機(jī)15分鐘后開門，接種人員迅速進(jìn)入接種室外間，關(guān)好外間的門穿戴好工作服，向空間噴75%的酒精消毒后再進(jìn)入里間。接種按無菌操作（同菌種部分）進(jìn)行。側(cè)面打穴接種一般用長55厘米塑料筒作料袋，接5穴，一側(cè)3穴，另一側(cè)2穴。3人一組，*個(gè)人先將打穴用的木棒的圓錐形尖頭放入盛有75%酒精的搪瓷杯中，酒精要浸沒木棒尖頭2厘米，再將要接種的料袋搬一個(gè)到桌面上，一手用75%的酒精棉紗擦抹料袋朝上的側(cè)面消毒，一手用木棒在消毒的料袋側(cè)面打穴3個(gè)。雙手用酒精棉球消毒后，直接用手把菌種掰成小棗般大小的菌種塊迅速填入穴中，菌種要把接種穴填滿，并略高于穴口。用膠粘紙封貼穴口或5個(gè)接種穴填滿菌種后用塑料筒作套袋（雙袋法）。接完種的菌袋即可進(jìn)培養(yǎng)室培養(yǎng)。
用接種箱接種，因箱體空間小，密封好，消毒*，所以接種成功率往往要高于接種室。但單人接種箱只能一個(gè)人操作，只適用于在短的料袋兩頭開口接種。如果是側(cè)面打穴接種，采用雙人接種箱，由兩個(gè)人共同操作，一個(gè)人負(fù)責(zé)打穴和貼膠粘紙封穴口，另一個(gè)人將菌種按無菌程序轉(zhuǎn)接于穴中。