內(nèi)毒素的活性部位為類脂a，它可以介導幾乎所有的內(nèi)毒素生物學反應。類脂a為一種特殊類型的磷脂，它通過核心的kdo成分而與內(nèi)毒素的多糖部分結(jié)合。應用溫和酸控制水解可將類脂a從內(nèi)毒素分子中裂解出來，此稱為游離類脂a（free lipid a），而存在于完整lps中的類脂a稱為結(jié)合類脂a（bound lipid a），游離類脂a在自然界中是不存在的。
類脂a的骨架是由一個β1’-6-糖苷鍵相聯(lián)的d-氨基葡萄糖雙糖單位所組成，骨架還原端的c1位及非還原端的c4’位均有磷酸基團所取代。骨架的羥基及氨基可由羥基脂肪酸或脂肪酰脂肪酸所取代。許多不同種屬的細菌甚至在分類學上相差甚遠的細菌，均具有基本一致的類脂a骨架，它們間的主要差別則是在骨架上取代脂肪酸碳原子數(shù)目或/和磷酸基團的取代不盡一致。隨著細菌的進化，其所合成的類脂a結(jié)構(gòu)愈為復雜，故而研究類脂a結(jié)構(gòu)對于了解細菌的進化具有重要的意義。許多不同種屬細菌所產(chǎn)生的類脂a具有較好的血清學反應性。類脂a為一種半抗原，但如與載體結(jié)合（復合抗原）則可誘導高滴度抗體的產(chǎn)生。
由于分析與合成化學家的密切合作，腸道菌（如沙門氏菌及大腸桿菌）的類脂a已進行了全分子化學合成?；瘜W合成的類脂a與天然類脂a在許多生物學系統(tǒng)中均能發(fā)揮一致的生物學反應。隨著其它類脂a及其眾多衍生物或同類物的化學合成，目前已有可能從分子/細胞水平上研究類脂a結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系。