受疫情影響，鹽田港暫停了五天的集裝箱出口，雖然5月31日零點(diǎn)重新恢復(fù)接收eta-3的出口貨柜，然而港口作業(yè)速度全面減緩，船期嚴(yán)重延誤、集裝箱周轉(zhuǎn)期延長數(shù)倍、集裝箱短缺問題惡化，同時(shí)船舶的跳港導(dǎo)致大量華南貨物涌向周邊的蛇口港和廣州南沙港。
而目前南沙港被洶涌的貨物攻陷出現(xiàn)擁堵，有的路段已成了停車場全天24小時(shí)擁堵。出現(xiàn)史無前例的排隊(duì)長龍，據(jù)了解，南沙拖車，至少需要提前5天排隊(duì)。
5日下午，南沙區(qū)發(fā)布通告稱，為配合全員核酸檢測工作，自6月5日14時(shí)起，全區(qū)城市公交、地鐵、輪渡、長途客運(yùn)暫停運(yùn)營，無特殊原因，市民不要離開，高快速路、高鐵、碼頭等全部離南沙通道暫時(shí)關(guān)閉，恢復(fù)時(shí)間另行通告。
6日最新通告已恢復(fù)運(yùn)營但加強(qiáng)進(jìn)港車輛司機(jī)管理，來自網(wǎng)友的信息：南沙港新龍橋高速入口6日下午4時(shí)已經(jīng)關(guān)閉，除承擔(dān)抗疫物資運(yùn)輸和必須出區(qū)采購生活物資車輛可通行外，其他一律等通知。
同時(shí)，鹽田港也發(fā)布《關(guān)于配合防疫檢查通告》：
各位司機(jī)：
根據(jù)政府防疫要求，所有進(jìn)港司機(jī)必須出示粵康碼和行程碼，非綠碼、以及近期曾到過南沙港的司機(jī)及車輛禁止進(jìn)港；即日開始執(zhí)行，請給予配合。
鹽田國際集裝箱碼頭
2021年6月6日
目前各港口情況如下：
鹽田港：eta在72小時(shí)內(nèi)還柜+預(yù)約還柜模式，6月8日后，當(dāng)天早上8點(diǎn)開放預(yù)約還出口重柜；近期曾到過南沙港的司機(jī)及車輛禁止進(jìn)港。
蛇口/赤灣港：eta在72小時(shí)內(nèi)還柜--自6月6日零點(diǎn)起調(diào)整收出口重箱時(shí)間，僅接收船舶預(yù)計(jì)到港日期（簡稱：eta）3天內(nèi)的出口重箱，赤灣自6月7日零時(shí)起，進(jìn)入碼頭須提供3天內(nèi)的核酸檢測報(bào)告，否則不予進(jìn)港；
大鏟灣：6月11日零時(shí)起，eta-7天。暫不允許外地拖車（非粵b車牌）車輛進(jìn)港；拖車司機(jī)需持有72小時(shí)核酸證明；
南沙港：eta-7天，部分道路封閉影響還柜提柜；及時(shí)篩查拖車司機(jī)隊(duì)伍，從中高風(fēng)險(xiǎn)地區(qū)來的人員，需強(qiáng)制隔離14天，經(jīng)兩次核酸監(jiān)測正常方能上崗，進(jìn)入港區(qū)開展作業(yè)。
“南沙港封閉，鹽田港只有三分之一的運(yùn)力得到恢復(fù)，接下來很長一段日子，將是國際物流最艱難的開始和考驗(yàn)?！?br>
不僅如此，若擁堵持續(xù)，國際海運(yùn)運(yùn)價(jià)或?qū)⒂瓉硇乱惠啙q價(jià)。