蛋白質(zhì)相互作用是指兩個或兩個以上蛋白質(zhì)分子通過非共價鍵形成蛋白質(zhì)復(fù)合物的過程。如復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯、細(xì)胞周期調(diào)控、物質(zhì)代謝等。
常見的研究方法有:
酵母雙雜交技術(shù)、免疫共沉淀、親和層析、細(xì)胞內(nèi)共定位分析。
以下是對免疫共沉淀技術(shù)(co-immunoprecipitation,co-ip)進(jìn)行總結(jié),co-ip常用來檢測兩種蛋白質(zhì)在體內(nèi)是否結(jié)合。
基本原理:
在保證兩種蛋白質(zhì)相互作用的條件下,收集并裂解細(xì)胞。在細(xì)胞裂解液中加入某一種已知蛋白的特異性抗體,孵育后再加入可與特異性抗體結(jié)合的蛋白a/g-瓊脂糖珠(或磁珠)沉淀收獲抗原抗體復(fù)合物,若細(xì)胞中存在與已知蛋白結(jié)合的目標(biāo)蛋白,則可被磁珠沉淀下倆,形成“目標(biāo)蛋白-已知蛋白-抗已知蛋白抗體-磁珠”復(fù)合物。經(jīng)sds-page后,復(fù)合物可被分離,再經(jīng)免疫印跡或質(zhì)譜鑒定出目標(biāo)蛋白。
優(yōu)勢:
① 得到的蛋白質(zhì)相互作用是在細(xì)胞內(nèi)天然形成的,反映的是細(xì)胞的生理狀態(tài);
② 可以分離得到天然狀態(tài)的蛋白質(zhì)復(fù)合物。
劣勢:
① 可能檢測不到低親和力的瞬時蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用;
② 不能證明兩種蛋白質(zhì)的直接結(jié)合,其他分子可能起到橋梁作用;
③ 依賴于高質(zhì)量的、可用于免疫沉淀的特異性抗體。
不同類型的免疫共沉淀技術(shù)
1、二次免疫共沉淀技術(shù):用來檢測細(xì)胞內(nèi)三種蛋白質(zhì)間的相互作用,若要證明x、y、z三種蛋白質(zhì)間是否以復(fù)合物形式存在,首先在細(xì)胞裂解液中加入抗x蛋白質(zhì)抗體,免疫沉淀獲得抗原抗體復(fù)合物,經(jīng)過非變性洗脫后,向此復(fù)合物溶液中加入抗蛋白質(zhì)y的抗體,再收集免疫復(fù)合物進(jìn)行sds-page分析。
2、蛋白質(zhì)降解抑制-免疫共沉淀:若兩種蛋白質(zhì)結(jié)合后,其中一種會降解,則會影響ip實(shí)驗(yàn)結(jié)果,故需要抑制細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解。
① 對于通過溶酶體途徑降解的蛋白質(zhì),可以加入nh4cl或氯喹改變細(xì)胞內(nèi)酸性環(huán)境,抑制這類蛋白質(zhì)降解。
② 對于通過泛素-蛋白酶體途徑降解的蛋白質(zhì),可用mg132抑制,該試劑對細(xì)胞有毒性,故作用時間不能太久。
3、核質(zhì)分離-免疫共沉淀:體內(nèi)的許多蛋白質(zhì)是在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核之間穿梭的,研究時有時會出現(xiàn)時空問題。故先利用核質(zhì)分離技術(shù)得到細(xì)胞核或細(xì)胞質(zhì)完整的組分。
4、交聯(lián)免疫共沉淀:能夠使已經(jīng)結(jié)合在一起的蛋白質(zhì)更加穩(wěn)定。避免結(jié)合能力弱或瞬時結(jié)合的蛋白質(zhì)在實(shí)驗(yàn)過程中降解。