(一)形態(tài)和構(gòu)造上的區(qū)別 銀杏雌株的苗木表現(xiàn)為莖干矮壯，發(fā)芽早，落葉遲的特點(diǎn)；成年樹葉片外緣缺刻淺，枝條開張，具層性，長枝比例小，樹冠稀疏。雄株則相反。但是，這些細(xì)微差別也受到多種因子的影響，有時(shí)變得難于辨別，只因方法簡(jiǎn)便，故也可用作初步判斷。 (一)形態(tài)和構(gòu)造上的區(qū)別 銀杏雌株的苗木表現(xiàn)為莖干矮壯，發(fā)芽早，落葉遲的特點(diǎn)；成年樹葉片外緣缺刻淺，枝條開張，具層性，長枝比例小，樹冠稀疏。雄株則相反。但是，這些細(xì)微差別也受到多種因子的影響，有時(shí)變得難于辨別，只因方法簡(jiǎn)便，故也可用作初步判斷。
日本學(xué)者阪本榮作在檢查了大量銀杏的雌雄株葉柄后發(fā)現(xiàn)，雌樹葉柄下方維管束周圍有油狀空隙，而雄樹葉柄則無此構(gòu)造。所以，葉柄的構(gòu)造，亦可用于判斷銀杏植株的性別。
(二)對(duì)化學(xué)藥品的反應(yīng)有區(qū)別 日本學(xué)者巖崎文雄，分別用重鉻酸鉀、硫酸銅、硫酸鋅、氯化鉀、2，2-二氯丙酸、2，4—d處理銀杏葉，結(jié)果都是雌樹葉子的反應(yīng)明顯。處理的具體方法是：剪取銀杏枝條，先在清水中浸2天，取出后再插入0．03％的氯酸鉀溶液中，先在黑暗中放兩天，而后讓其見光，注意不要在陽光下曝曬，并換上清水，一周后雌樹枝條上的葉片先開始凋萎，再過幾天，雄樹枝條上葉片才開始凋萎。
用藥物處理判別銀杏的雌雄性別，其原理是兩者的酶系統(tǒng)有明顯的區(qū)別，特別是過氧化氫酶的活性有明顯的區(qū)別。雄樹酶活性強(qiáng)，解毒作用也強(qiáng)，所以受害較遲較少。雌樹則正好相反。由此可見，除了上述藥物，如果使用其他氧化劑處理，有可能也能得到相似的結(jié)果。
(三)酶活性和酶譜方面的差別浙江麗水林校測(cè)定了雌雄銀杏葉片過氧化氫酶的活性，發(fā)現(xiàn)雄株明顯高于雌株，其活力相差1．4倍以上。