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        病毒研究用水系列四:測(cè)序儀用水對(duì)結(jié)果的影響

        發(fā)布時(shí)間:2024-08-17
        基因測(cè)序技術(shù)是一種基因檢測(cè)技術(shù),也被稱(chēng)為dna測(cè)序技術(shù),是進(jìn)行分子生物學(xué)研究和基因改造的基礎(chǔ),也是解鎖人類(lèi)生命奧秘的重要方式之一。基因測(cè)序技術(shù)發(fā)展了40余年,已在眾多領(lǐng)域被廣泛應(yīng)用,包括生物的基因組圖譜繪制、物種進(jìn)化演替過(guò)程、表觀(guān)遺傳學(xué)、疾病相關(guān)基因的確定和診斷等等。近年來(lái),基因測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)由實(shí)驗(yàn)室研究演變到臨床使用,為我們理解人類(lèi)生物學(xué)特征和疾病,評(píng)估遺傳疾病提供了關(guān)鍵性信息,所以說(shuō)基因測(cè)序技術(shù)是下一個(gè)改變世界的技術(shù)毫不為過(guò)。
        在疫情期間,這項(xiàng)技術(shù)得到了更多人的關(guān)注。疫情爆發(fā)初期,在不到一個(gè)月的時(shí)間內(nèi),通過(guò)基因測(cè)序技術(shù),病毒的基因組序列被公布,為分析病毒的進(jìn)化來(lái)源、致病機(jī)制提供了一手資料。不少也發(fā)起了患者基因測(cè)序計(jì)劃,以了解個(gè)人基因?qū)Σ《靖腥痉磻?yīng)的影響,這項(xiàng)研究的數(shù)據(jù)將為患者護(hù)理及藥物處方提供信息,未來(lái)還可以幫助疫苗設(shè)計(jì),從而拯救更多生命。
        整個(gè)測(cè)序環(huán)節(jié)中,從樣品收集到上機(jī)測(cè)序,水貫穿了包括測(cè)序儀的日常清洗維護(hù)和試劑配制在內(nèi)的每一個(gè)環(huán)節(jié)。作為一個(gè)*的基礎(chǔ)試劑,水的品質(zhì)對(duì)終測(cè)序結(jié)果會(huì)產(chǎn)生顯著影響。水中的雜質(zhì),如無(wú)機(jī)鹽、有機(jī)物、核酸酶、顆粒物等,不僅會(huì)污染設(shè)備,縮短測(cè)序儀毛細(xì)管的使用壽命,而且還會(huì)降低dna聚合酶的活性,終干擾測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性。
        下面這些基因測(cè)序經(jīng)常遇到的問(wèn)題很有可能是使用的水有問(wèn)題,快來(lái)看看你有沒(méi)有中招…
        q1:dna測(cè)序樣品用什么溶劑溶解比較好?
        溶解dna測(cè)序樣品,使用超純水溶解較好。
        原因:dna的測(cè)序反應(yīng)的原理其實(shí)就是taq酶的聚合反應(yīng),需要一個(gè)適合的酶反應(yīng)條件。如果溶解dna樣品的溶液含有過(guò)多的鹽,會(huì)影響測(cè)序反應(yīng)體系,造成taq酶的聚合性能下降,干擾測(cè)序反應(yīng)甚至無(wú)法產(chǎn)生信號(hào)。
        純水應(yīng)用tips:超純水機(jī)采用基因測(cè)序超純化柱,rephile 配方填料的低鎂型純化柱,可以特異性去除水中的鎂離子,降低空白本底對(duì)測(cè)序反應(yīng)體系的影響。
        q2:測(cè)序結(jié)果怎么沒(méi)有峰圖呢?
        原因:模板被降解,罪魁禍?zhǔn)卓赡苁菧y(cè)序使用的水中含有核酸酶。
        純水應(yīng)用tips:制備超純水的超純水機(jī)需要帶有終端濾器,如樂(lè)楓生物的rephibio終端濾器,可以去除dna酶和rna酶。
        q3:為什么測(cè)序峰圖出現(xiàn)了“瀑布效應(yīng)”?
        “瀑布效應(yīng)”是基線(xiàn)突然從高處下降的現(xiàn)象。
        原因:樣品被有機(jī)物污染,有機(jī)物會(huì)被激發(fā)產(chǎn)生熒光,抬高基線(xiàn)。
        純水應(yīng)用tips:使用帶有toc檢測(cè)系統(tǒng)的超純水機(jī),如樂(lè)楓genie系列智能超純水系統(tǒng),有機(jī)物含量低于5 ppb,采用全氧化法設(shè)計(jì)的toc在線(xiàn)監(jiān)測(cè)系統(tǒng),在線(xiàn)監(jiān)測(cè)toc含量,符合ispe制藥工程指南 / 美國(guó)藥典usp等標(biāo)準(zhǔn)對(duì)于toc檢測(cè)的要求。
        q4:“釘子峰”如何避免?
        “釘子峰”是a、t、c、g四個(gè)顏色的峰都被突然拔起,形成的尖銳峰形。
        原因:溶液中可能存在氣泡或者顆粒,氣泡和顆粒對(duì)激光全反射,形成“釘子峰”。
        純水應(yīng)用tips:純水機(jī)取水口配備0.22μm的終端濾器,測(cè)序之前使用超聲波對(duì)超純水進(jìn)行脫氣可以有效地防止“釘子峰”。
        樂(lè)楓生物genie系列智能純水系統(tǒng)以穩(wěn)定的水質(zhì)、智能的操作系統(tǒng)充分滿(mǎn)足基因測(cè)序用水需求,在諸多應(yīng)用到測(cè)序儀的實(shí)驗(yàn)室常常會(huì)看到樂(lè)楓生物genie系列智能超純水系統(tǒng)的身影。華大基因海外“火眼實(shí)驗(yàn)室”采用的超純水機(jī)是genie 系列的超純水系統(tǒng)。
        關(guān)于樂(lè)楓生物
        樂(lè)楓生物(rephile bioscience,ltd.) 是一家專(zhuān)業(yè)從事水純化和實(shí)驗(yàn)室分離純化產(chǎn)品研發(fā)、設(shè)計(jì)和制造的企業(yè),為高科技生物技術(shù)和生命科學(xué)領(lǐng)域的用戶(hù)服務(wù)。樂(lè)楓公司著眼于發(fā)展,在中國(guó)、美國(guó)、法國(guó)、印度、南非等近20個(gè)建立了銷(xiāo)售機(jī)構(gòu),同時(shí)也為大型公司提供oem和odm,產(chǎn)品銷(xiāo)往包括歐美的近100個(gè)。成立十余年,樂(lè)楓持續(xù)投入研發(fā),創(chuàng)立出了自己的產(chǎn)品品牌rephile(瑞楓),推出了多個(gè)新概念產(chǎn)品- 無(wú)線(xiàn)連接的genie系列純水系統(tǒng)和智能型大流量純水工作站super-genie等。目前樂(lè)楓純化柱填料配方齊全,也提供多款密理博純水系統(tǒng)的兼容耗材。
        關(guān)鍵詞:純水,超純水,實(shí)驗(yàn)室,genie純水機(jī),基因測(cè)序,測(cè)序峰圖,樂(lè)楓
        關(guān)注rephile 公眾號(hào):樂(lè)楓純水,關(guān)注樂(lè)楓動(dòng)態(tài)!
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