[techweb]作為全球big pharma合作的一部分,數(shù)字分子設(shè)計(jì)師schrödinger正在與google的云計(jì)算部門合作,擴(kuò)大對(duì)新型冠狀病毒的研究力度,以篩選出潛在的抗病毒藥物。
對(duì)于參與covid-19計(jì)劃(其中還包括takeda,novartis,gilead和wuxi apptec)的一部分,schrödinger計(jì)劃每周虛擬評(píng)估數(shù)十億個(gè)小分子,以尋找可能與不同蛋白質(zhì)靶標(biāo)匹配的小分子。
google cloud向該項(xiàng)目提供了新的大量并行計(jì)算資源捐款,該項(xiàng)目將為自由能評(píng)估和其他基于物理的建模應(yīng)用程序總計(jì)進(jìn)行約1600萬小時(shí)(或1,826年)的計(jì)算工作。
隨著數(shù)千個(gè)處理器同時(shí)運(yùn)行,schrödinger希望將更傳統(tǒng)的藥物發(fā)現(xiàn)工作節(jié)省數(shù)月至數(shù)年。在發(fā)現(xiàn)階段之后,該計(jì)劃的合作伙伴將通過優(yōu)化,合成和臨床測(cè)試來攜帶鉛分子。
google cloud醫(yī)療保健產(chǎn)品管理總監(jiān)joe corkery說“像所有在這個(gè)聯(lián)盟的合作伙伴,我們理解covid-19帶來的重大的公共衛(wèi)生挑戰(zhàn),我們很自豪能夠成為促進(jìn)我們的計(jì)算能力,加快新療法的潛在鑒定對(duì)抗病毒的斗爭(zhēng)中,” 。
schrödinger先前于3月初與google cloud進(jìn)行了合作,并計(jì)劃使用數(shù)千個(gè)處理器為其分子建模平臺(tái)提供動(dòng)力。該公司計(jì)劃首先專注于將小分子抑制劑用于dna損傷反應(yīng)途徑和相關(guān)癌癥的靶標(biāo),并于明年上半年啟動(dòng)臨床前研究。
schrödinger首席技術(shù)官pat表示:“ google cloud一直是我們的重要技術(shù)合作伙伴,因?yàn)槲覀冊(cè)诤献骱蛢?nèi)部藥物發(fā)現(xiàn)計(jì)劃中不斷突破計(jì)算建模的局限,以更快的速度和更低的成本鑒定出高質(zhì)量的分子。”洛頓。
洛頓補(bǔ)充說:“我們很高興能夠?qū)⑦@種大膽的化學(xué)勘探方法擴(kuò)展到covid-19項(xiàng)目,這對(duì)全球公共衛(wèi)生至關(guān)重要。” “通過計(jì)算機(jī)發(fā)現(xiàn)高質(zhì)量的新穎分子需要強(qiáng)大的計(jì)算能力,而google cloud的gpu信譽(yù)對(duì)這項(xiàng)工作至關(guān)重要。”[techweb]